Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms