Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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