Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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