Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAM2Q15035 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms