Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC106017.1-202ENST00000424109 428 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC007952.3-202ENST00000435028 428 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 LINC01411-203ENST00000507361 2098 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 KCNJ15-208ENST00000398938 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 RNASE9-207ENST00000555230 2668 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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MKRN4PQ13434 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC01761-201ENST00000424943 2755 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF157-201ENST00000377073 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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