Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms