Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms