Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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