Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms