Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GDAP2Q9NXN4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms