Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms