Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CLIP4Q8N3C7 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLIP4Q8N3C7 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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