Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms