Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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