Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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