Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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