Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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