Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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