Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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