Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms