Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms