Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 Z83838.1-201ENST00000431036 925 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC002094.5-201ENST00000623773 629 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms