Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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