Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms