Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms