Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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