Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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