Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FAM187BQ17R55 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms