Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FSCN1Q16658 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms