Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms