Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CTF1Q16619 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01827-201ENST00000432711 555 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CTF1Q16619 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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CTF1Q16619 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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CTF1Q16619 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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