Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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