Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01808-203ENST00000641932 1643 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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