Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NPRL3Q12980 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms