Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFFO1Q0D2I5 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms