Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM3AP98173 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms