Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRCP08575 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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