Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC098657.2-201ENST00000567886 1976 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL109810.2-201ENST00000425559 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TLK2P2-201ENST00000414066 2240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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