Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CPA4Q9UI42 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CPA4Q9UI42 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms