Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms