Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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