Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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