Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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ITGA9Q13797 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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