Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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