Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RPS29P62273 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RPS29P62273 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPS29P62273 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms