Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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