Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXA13P31271 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXA13P31271 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXA13P31271 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXA13P31271 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
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HOXA13P31271 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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HOXA13P31271 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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HOXA13P31271 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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HOXA13P31271 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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HOXA13P31271 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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