Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
POLR2AP24928 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms