Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR8B9P-201ENST00000419756 925 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms