Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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